一、先认识什么是商标转让合同纠纷。

商标转让合同纠纷简单来说就是买卖双方的合同纠纷。常说的许可商标权，也会有商标许可合同纠纷。商标代理等都会有合同纠纷，只是对应务不一样而已。

二、在商标权转让合同中争议有以下：

1.转让方违约。

未按合同约定向受让人交接注册商标相关的材料；

转让的商标权因期满未申请续展，被国家商标局依法撤销等原因而无效；

违反商标法规定，在相同或者近似商品上注册的相同或者近似商标未一并转让的；

转让方在转让注册商标前与第三方签订商标授权合同的，未经授权方同意转让注册商标的；

未按照商标法规定向国家商标局申请注册或者转让商标的；

2.受让人方违约。

受让人不符合商标法规定的资质条件；

受让方未按照合同约定的条件(包括金额、期限、方式等)向转让方支付注册商标的转让价款。)

受让人使用注册商标生产的商品或者服务不符合合同约定的质量要求。

受让人未按照有关规定，向商标局申请的是不被受理的。

综上，不管是哪一方都要在商标转让合同中注明并履行自身的职责，诚意交易合作。